262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2257 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 324 aa  671    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  62.42 
 
 		 320 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  58.51 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  55.17 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  54.6 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  48.24 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  48.06 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.92 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  37.42 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  35.62 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.2 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  34.56 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  37.16 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  38.39 
 
 		 355 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  37.07 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  36.36 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  37.1 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  38.89 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  34.85 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  35.28 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.31 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  38.12 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  37.03 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  35.08 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.24 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.89 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  35.64 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  37.5 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.29 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.89 
 
 		 404 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  38.17 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.83 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  37.94 
 
 		 366 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  37.99 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  38.59 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  37.42 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  38.05 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  37.5 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.69 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  35.22 
 
 		 415 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 		 357 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  36.47 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.53 
 
 		 386 aa  188  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  37.89 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  35.6 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  34.97 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  33.86 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.76 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 354 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.29 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.97 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.97 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  36.45 
 
 		 398 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  38.44 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.34 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  35.49 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.34 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  37.54 
 
 		 373 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.7 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  34.67 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.31 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  34.51 
 
 		 409 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.97 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  37.17 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  35.42 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  36.74 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  34.39 
 
 		 411 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  36.68 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  36.68 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  34.99 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.78 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.78 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.78 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  34.38 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.78 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.78 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  34.86 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 379 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  35.38 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.11 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  36.24 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.23 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.49 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  36.25 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.48 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3214  iron-sulfur cluster binding protein  33.43 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  35.99 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>