281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1876 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 314 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  56.48 
 
 		 318 aa  361  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  54.78 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  52.79 
 
 		 314 aa  322  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  51.46 
 
 		 320 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  48.24 
 
 		 324 aa  310  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  49.19 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.58 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  39.68 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  39.8 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  39.86 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39.1 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  36.45 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  39.93 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  39.93 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  34.81 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  36.39 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  36.28 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  36.28 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  36.16 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.44 
 
 		 379 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 379 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  35.96 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 384 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 384 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 384 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.33 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.22 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  36.09 
 
 		 362 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  36.1 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  36.09 
 
 		 362 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  35.65 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.33 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.02 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  35.02 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  35.44 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  35.05 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  34.47 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  36.52 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  34.07 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  36.52 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.18 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  36.31 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.41 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  34.31 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  34.18 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  33.44 
 
 		 321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  36.67 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  34.8 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  35.46 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  36.67 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  33.11 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.59 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  35.76 
 
 		 379 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  36.93 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.01 
 
 		 364 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  36.36 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.07 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  33.77 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.71 
 
 		 362 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  34.49 
 
 		 374 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.56 
 
 		 397 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  34.45 
 
 		 380 aa  179  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  35.2 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  36.79 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  35.76 
 
 		 382 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  34.38 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  34.8 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  33.54 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  35.29 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  33.66 
 
 		 404 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  36.88 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.58 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  34.62 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  37.42 
 
 		 363 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  31.52 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  32.79 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  31.52 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.26 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  35.67 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.67 
 
 		 398 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  35.28 
 
 		 409 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.23 
 
 		 354 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.28 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.28 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.28 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.28 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.78 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.28 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  34.07 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>