276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3176 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  745    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  41.08 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  46.56 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  43.38 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  39.3 
 
 		 312 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  39.8 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.77 
 
 		 357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  40.19 
 
 		 308 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  44.38 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  40.91 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  40.58 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.87 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  44.51 
 
 		 347 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  39.08 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  41.97 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  40.92 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.62 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  40.57 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.05 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  39.89 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  40.95 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.26 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  40 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  40.39 
 
 		 445 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  40.34 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  39.26 
 
 		 315 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  41.31 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  40.35 
 
 		 438 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  39.24 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.34 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.26 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.06 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  40.11 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  39.71 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  37.69 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.78 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  41.55 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  39.15 
 
 		 392 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  42.42 
 
 		 385 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  37.21 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.86 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  40.1 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  37.86 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.38 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  37.6 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.86 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  36.44 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  34.72 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  36.44 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.57 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  37.6 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  37.43 
 
 		 379 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.44 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  38.1 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  40.86 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.98 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  41.62 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  39.02 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  36.22 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  40.46 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  34.15 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  42.82 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  37.33 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  36.07 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 		 379 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  40.46 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.4 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  40.22 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  34.83 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  43.11 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  39.77 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  33.07 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  37.71 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.98 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  39.22 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  43.11 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0567  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.99 
 
 		 351 aa  209  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000095746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  37.39 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  37.64 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  38.14 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  37.02 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.28 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.95 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.28 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  38.76 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  38.18 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  37.13 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  36.07 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>