296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0304 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 326 aa  680    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  58.47 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  55.48 
 
 		 312 aa  364  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  54.25 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  55.87 
 
 		 315 aa  361  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  51.96 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  56.23 
 
 		 314 aa  349  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  53.36 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  47.23 
 
 		 317 aa  289  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.91 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  48.6 
 
 		 363 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  43.09 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.04 
 
 		 362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  43.23 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  45.98 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.62 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  46.11 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  46.84 
 
 		 438 aa  272  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  46.98 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  46.15 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  45.65 
 
 		 362 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  43.89 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.83 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  46.01 
 
 		 379 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  45.83 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  44.84 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  46.95 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  42.72 
 
 		 312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.27 
 
 		 388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  46.03 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  46.03 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  45.66 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  45.31 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.34 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  43.23 
 
 		 311 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.66 
 
 		 355 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  45.34 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  45.89 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  44.23 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  41.64 
 
 		 323 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  43.67 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  45.34 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.01 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  43.99 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.99 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.01 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.99 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  44.05 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  44.05 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  44.05 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  44.52 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  44.05 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  44.05 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  44.05 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  44.05 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  44.84 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  44.59 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  44.05 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  44.27 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  42.57 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  43.92 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  43.73 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  44.52 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  46.56 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  42.59 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  45.21 
 
 		 373 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  44.81 
 
 		 392 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.9 
 
 		 409 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  42.61 
 
 		 409 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.33 
 
 		 343 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  42.61 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.61 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.61 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.61 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  44.98 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.61 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  42.61 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  44.48 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.39 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  45.03 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  42.82 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  43.41 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.77 
 
 		 384 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.77 
 
 		 384 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.63 
 
 		 384 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.63 
 
 		 384 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.63 
 
 		 384 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  41.85 
 
 		 370 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  42.77 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  42.72 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.81 
 
 		 375 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  42.63 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  42.63 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.33 
 
 		 368 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  43.11 
 
 		 404 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.28 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  42.81 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  44.63 
 
 		 345 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>