275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3534 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  792    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  74.74 
 
 		 383 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  74.53 
 
 		 385 aa  577  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  71.04 
 
 		 390 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  67.83 
 
 		 393 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  66.85 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  66.76 
 
 		 398 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  65.5 
 
 		 383 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  61.23 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.94 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  61.2 
 
 		 385 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  62.91 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.75 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.88 
 
 		 382 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  60.77 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  61.16 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  56.37 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  60.23 
 
 		 372 aa  428  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  59.6 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  57.94 
 
 		 374 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  59.44 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  59.88 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.67 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  59.18 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  57.96 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  61.35 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  61.24 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.52 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  58.7 
 
 		 348 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  63.04 
 
 		 325 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  58.41 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  59.57 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  59.82 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.42 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  56.16 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  59.18 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  63.05 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  43.84 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  45.67 
 
 		 380 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  45.75 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  44.08 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  47.43 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  43.1 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.11 
 
 		 355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.7 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  44.08 
 
 		 385 aa  272  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  43.7 
 
 		 360 aa  272  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.44 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.34 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  41.76 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  43.2 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  44.1 
 
 		 351 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  41.12 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.57 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  43.87 
 
 		 379 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  40.82 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.67 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  45.11 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  43.55 
 
 		 379 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  43.31 
 
 		 359 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  45.37 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.3 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  41.55 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.72 
 
 		 332 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.77 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  43.03 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  44.48 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  42.03 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  44.13 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  41.39 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.47 
 
 		 357 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  44.34 
 
 		 373 aa  253  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  43.87 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 		 386 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  42.47 
 
 		 362 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  43.44 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  43.69 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.57 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  43.81 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  41.23 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  43.63 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  41.34 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  43.53 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.17 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  40.88 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.31 
 
 		 357 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  41.88 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.26 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.29 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  39.39 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  41.08 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  41.29 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>