266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1141 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 357 aa  715    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  62.39 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  70.69 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  59.71 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  59.42 
 
 		 398 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.03 
 
 		 375 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.68 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  60.47 
 
 		 383 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.65 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  60.64 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  59.82 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.16 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  61.66 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  57.8 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  61.52 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.87 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.18 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  58.6 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  57.34 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  59.18 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  58.89 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  58.02 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  60.64 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  60.81 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  57.82 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  61.17 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  58.14 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  58.43 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  59.31 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  59.21 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  61.27 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  60.47 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  60.36 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  54.34 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  55.43 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  65.74 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  59.11 
 
 		 363 aa  358  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  45 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  45.53 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  42.41 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  44.38 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  45.04 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.69 
 
 		 355 aa  278  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  44.84 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.23 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  41.11 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  43.18 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  41.52 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  44.48 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  43.6 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.72 
 
 		 386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  44.01 
 
 		 372 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.17 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  40.52 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.15 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  43.05 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.67 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  41.06 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  39.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  42.36 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.03 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  39.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  39.94 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  40.58 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.07 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  41.88 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  42.53 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  39.3 
 
 		 379 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  40.78 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.03 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  42.57 
 
 		 400 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.38 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  41.3 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.01 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  39.59 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  41.83 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.97 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.48 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  42.33 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 		 351 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.98 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 354 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.66 
 
 		 397 aa  255  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  42.65 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.88 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  41.85 
 
 		 380 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  41.11 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>