272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3132 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  72.44 
 
 		 392 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  72.86 
 
 		 349 aa  501  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  73.12 
 
 		 356 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  69.69 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  58 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  62.14 
 
 		 383 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  56.86 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.14 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  59.6 
 
 		 387 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  59.31 
 
 		 385 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  60.52 
 
 		 383 aa  421  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.64 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  57.98 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  57.18 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  56.16 
 
 		 383 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.38 
 
 		 380 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  56.45 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  57.14 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.56 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  58.51 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  58.28 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  61.13 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  61.44 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  59.62 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  56.27 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.43 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  63.16 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  58.84 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  60.25 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.81 
 
 		 343 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.06 
 
 		 349 aa  358  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  59.63 
 
 		 325 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.64 
 
 		 382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  61.61 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  59.11 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  63.86 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  47.6 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  48.09 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.25 
 
 		 355 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  47.12 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  44.31 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.54 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  45.05 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  45.85 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  44.65 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.6 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  45.16 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  46.98 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.99 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  42.6 
 
 		 369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  46.58 
 
 		 356 aa  268  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  42.51 
 
 		 387 aa  268  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.17 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  43.97 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  43.56 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.14 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.8 
 
 		 357 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  45.02 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  43.17 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.48 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  42.42 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.27 
 
 		 386 aa  259  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  43.16 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  43.37 
 
 		 379 aa  255  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.41 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  43.45 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  43.73 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.39 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.73 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  45.34 
 
 		 354 aa  252  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  42.39 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  46.24 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  43.45 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  43.45 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.29 
 
 		 379 aa  248  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.27 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  42.95 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  45.33 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  43.12 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  39.38 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0567  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.35 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000095746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  42.17 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  43.71 
 
 		 349 aa  246  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  42.95 
 
 		 354 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  42.71 
 
 		 445 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  42.29 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  39.69 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1131  iron-sulfur cluster binding protein  43.61 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.264081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  43.64 
 
 		 373 aa  242  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>