273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3307 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  100 
 
 		 344 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  74.63 
 
 		 343 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  72.19 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  71.26 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  71.55 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  73.17 
 
 		 343 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  69 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.04 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  63.91 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  62.94 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  63.24 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.83 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  58.89 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.61 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  61.47 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  61.95 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  61.68 
 
 		 390 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  61.24 
 
 		 387 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  58.24 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.61 
 
 		 375 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.93 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  57.94 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  60.41 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  63.44 
 
 		 385 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  60.95 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  59.59 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  61.52 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  63.52 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  60.25 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  69.37 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  63.06 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  59.62 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  57.6 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  58.01 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  61.58 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  65.14 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  59 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  48.83 
 
 		 363 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  47.49 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  48.4 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.67 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  45.75 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.38 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  42.82 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  45.16 
 
 		 385 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  42.73 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  44.71 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  44.48 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.91 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  42.15 
 
 		 355 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  43.31 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  41.3 
 
 		 355 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  42.44 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  46.81 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.6 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.44 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  42.71 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.59 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  43.31 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  42.18 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  44.9 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  42.25 
 
 		 377 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  44.59 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  42.25 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  42.68 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.21 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  41.96 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  44.34 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.81 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.52 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  42.15 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.8 
 
 		 368 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.93 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  44.41 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.28 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  41.86 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.91 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  41.91 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  44.04 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.45 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  44.04 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.2 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.71 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.2 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  42.77 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.01 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.2 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  44.2 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.2 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  41.45 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  42.77 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.88 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.8 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  43.45 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>