268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2806 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  709    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  70.85 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  69.94 
 
 		 348 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  69.65 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  67.45 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  70.57 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  69.41 
 
 		 344 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  63.53 
 
 		 370 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.05 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  62.57 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.31 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.56 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  59.24 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.57 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  60.12 
 
 		 383 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  62.65 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  56.94 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.94 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  59.12 
 
 		 387 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  59.59 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  59.6 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  58.26 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  58.96 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  60.29 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  60.81 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  62.14 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  62.54 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  57.02 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  59.83 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  60.76 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  58.39 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  57.32 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.75 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  62.8 
 
 		 353 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  65.38 
 
 		 325 aa  359  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  58.77 
 
 		 382 aa  352  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  54.27 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  47.26 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.02 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  44.9 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  45.95 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  43.7 
 
 		 387 aa  275  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  44.79 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  50.52 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  43.85 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  45.89 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  47.56 
 
 		 385 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  45.24 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  42.98 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  44.29 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.65 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  43.31 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.99 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  47.04 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.99 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  42.61 
 
 		 356 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  43.09 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  45.17 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  40.59 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  41.78 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  43.57 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  41.95 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  42.44 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.57 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  42.44 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  43.26 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.16 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.33 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  43.09 
 
 		 355 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  43.97 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  41.42 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  43.29 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  43.26 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  42.12 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.11 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  43.89 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  45.49 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  41.11 
 
 		 382 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  40.61 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.48 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  42.3 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  40.68 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  40.23 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  41.18 
 
 		 411 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  44.34 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  44.8 
 
 		 355 aa  245  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.6 
 
 		 393 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  43.75 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.45 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.34 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  41.8 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  40.58 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  44.69 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.98 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.77 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  40.29 
 
 		 400 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>