278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2662 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 392 aa  790    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  96.56 
 
 		 349 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  91.01 
 
 		 356 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  72.44 
 
 		 363 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  68.65 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  58.82 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.75 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  61.14 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.97 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  57.69 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60 
 
 		 380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  58.58 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  57.49 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  58.27 
 
 		 370 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  56.37 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  58.74 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  57.1 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.83 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  56.46 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  64.31 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  62.13 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  60.95 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  61.83 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  55.32 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  57.42 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  58.54 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  59.76 
 
 		 347 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  60.95 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  54.03 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.71 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  54.62 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.27 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  57.34 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.65 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  64.07 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  61.49 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  58.36 
 
 		 350 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  41.1 
 
 		 387 aa  282  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  45.93 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.73 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  44.09 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  43.5 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  42.58 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.7 
 
 		 357 aa  272  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.19 
 
 		 355 aa  269  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.64 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  43.35 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  45.28 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  44.75 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  41.62 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  42.77 
 
 		 363 aa  262  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  41.09 
 
 		 355 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  42.67 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  43.85 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.95 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.52 
 
 		 373 aa  259  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  43.61 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  44.81 
 
 		 326 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  43.87 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  41.21 
 
 		 360 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.32 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.12 
 
 		 332 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  40.41 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  40.79 
 
 		 362 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  36.49 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  40.94 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  40.64 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.18 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.35 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  39.81 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  40.8 
 
 		 351 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  35.92 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  40.52 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  43.75 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  40.94 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  40.89 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  41.97 
 
 		 411 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  40.38 
 
 		 369 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.16 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.23 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.81 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  41.27 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  39.89 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  40.63 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  40.77 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  38.35 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  36.97 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  39.13 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  40.76 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3214  iron-sulfur cluster binding protein  41.23 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.31 
 
 		 409 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  40.45 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  38.6 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>