262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0460 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  830    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  68.34 
 
 		 405 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  67.34 
 
 		 405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  48.94 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  48.4 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.66 
 
 		 384 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.66 
 
 		 384 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.66 
 
 		 384 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.66 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.66 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  50 
 
 		 368 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  46.19 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.21 
 
 		 355 aa  345  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  46.67 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  48.29 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  48.24 
 
 		 375 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  47.33 
 
 		 375 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  49.86 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.85 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  46.9 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.39 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  46.21 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.94 
 
 		 373 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  47.75 
 
 		 369 aa  338  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.49 
 
 		 357 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  46.97 
 
 		 372 aa  338  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  46.98 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  48.87 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  50.7 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.41 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  48.6 
 
 		 369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  46.83 
 
 		 355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.34 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  46.63 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.61 
 
 		 379 aa  336  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  46.46 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  47.3 
 
 		 359 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  49.03 
 
 		 354 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  46.93 
 
 		 354 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  46.94 
 
 		 354 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  48.61 
 
 		 372 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.71 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.87 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  45.9 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  45.74 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  46.83 
 
 		 393 aa  328  9e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  46.74 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.66 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.19 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  45.65 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.69 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.55 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.35 
 
 		 387 aa  326  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  44.36 
 
 		 411 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  44.36 
 
 		 411 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  45.29 
 
 		 400 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.67 
 
 		 393 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 		 357 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0521  iron-sulfur cluster binding protein  44.67 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  45.01 
 
 		 370 aa  322  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.43 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.14 
 
 		 393 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.48 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.35 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  45.94 
 
 		 356 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.13 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.73 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.73 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.73 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  44.73 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  46.69 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.99 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  45.68 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.73 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  44.77 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  45.89 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  43.85 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  43.96 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.83 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  43.91 
 
 		 411 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.96 
 
 		 409 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1131  iron-sulfur cluster binding protein  47.15 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.264081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  44.41 
 
 		 351 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  45.78 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0748  4Fe-4S cluster binding  42.14 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  45.73 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  43.4 
 
 		 382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  44.72 
 
 		 438 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  45.78 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  43.65 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  44.74 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>