273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0524 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  100 
 
 		 405 aa  849    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  92.82 
 
 		 405 aa  793    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  71 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.3 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.3 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.04 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.04 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.08 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.04 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.11 
 
 		 386 aa  346  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  49.86 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  49.15 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  49.15 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  49.15 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.74 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  49.15 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  49.15 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  49.15 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  49.15 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  47.78 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  49.16 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  47.29 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  47.19 
 
 		 361 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  46.26 
 
 		 362 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.7 
 
 		 393 aa  342  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  47.69 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  48.58 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.77 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  47.95 
 
 		 379 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  46.54 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  47.03 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  47.11 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.03 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  48.6 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.59 
 
 		 355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  46.47 
 
 		 354 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.03 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.93 
 
 		 395 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  45.98 
 
 		 354 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  50.42 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.03 
 
 		 391 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.98 
 
 		 354 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  46.43 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.21 
 
 		 357 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  47.43 
 
 		 361 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.35 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  46.74 
 
 		 379 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.6 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.37 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  45.58 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  45.58 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.18 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  46.09 
 
 		 375 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  45.33 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.81 
 
 		 400 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.26 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.38 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  47.16 
 
 		 369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  45.99 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  45.99 
 
 		 385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  46.09 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  46.3 
 
 		 354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  45.58 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  46.96 
 
 		 379 aa  326  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  47.04 
 
 		 372 aa  325  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  49.16 
 
 		 387 aa  325  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.41 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  46.9 
 
 		 354 aa  323  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  45.33 
 
 		 438 aa  322  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  44.23 
 
 		 385 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  44.89 
 
 		 375 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  44.47 
 
 		 372 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  47.61 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.48 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  44.27 
 
 		 355 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  45.11 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  44.17 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1131  iron-sulfur cluster binding protein  46.76 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.264081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  44.75 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  44.63 
 
 		 373 aa  312  7.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  44.03 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  43.21 
 
 		 393 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.81 
 
 		 332 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  40.95 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  41.45 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  42.42 
 
 		 351 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  40.55 
 
 		 383 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.3 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  41.89 
 
 		 360 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.92 
 
 		 361 aa  298  9e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3214  iron-sulfur cluster binding protein  40.83 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  43.61 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  41.93 
 
 		 404 aa  298  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.76 
 
 		 409 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0567  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.14 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000095746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  39.76 
 
 		 411 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0748  4Fe-4S cluster binding  39.12 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>