281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0597 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 364 aa  756    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  58.22 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  60 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  59.78 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  57.38 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  57.1 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3214  iron-sulfur cluster binding protein  52.99 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  57.68 
 
 		 349 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0748  4Fe-4S cluster binding  54.16 
 
 		 418 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  55.26 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  53.44 
 
 		 382 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  54.23 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  53.97 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.7 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  53.11 
 
 		 411 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  53.97 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.97 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  53.97 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  54.23 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  54.23 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.97 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.97 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  53.58 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0521  iron-sulfur cluster binding protein  52.42 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  55.75 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.97 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  53.89 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  54.99 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  57.82 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  53.52 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  54.6 
 
 		 370 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  54.57 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  55.71 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  53.63 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  53.54 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  53.22 
 
 		 385 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  52.21 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  56.02 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  52.21 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  53.14 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  52.11 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.53 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  52.09 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.53 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.82 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  55.13 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1131  iron-sulfur cluster binding protein  56.02 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.264081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.82 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  52.57 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  52.87 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  55.43 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.53 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  52.37 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  52.57 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  52.57 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  52.86 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  52.22 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  52.57 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  52.57 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  52.57 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  52.57 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  51.82 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  52.57 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.1 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  52.07 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  51.38 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  51.97 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  51.99 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  53.3 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  51.4 
 
 		 354 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  54.41 
 
 		 379 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  55.03 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  51.69 
 
 		 354 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  53.74 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  50.98 
 
 		 354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  51.13 
 
 		 374 aa  362  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  53.12 
 
 		 356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  52.06 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  51.43 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  56.23 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  52.34 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  50.14 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  52.08 
 
 		 354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  49.85 
 
 		 375 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  48.6 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  51.72 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  52.21 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  49.03 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.14 
 
 		 338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  49.86 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.64 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.37 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  50 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  49.86 
 
 		 407 aa  349  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  49.56 
 
 		 375 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  48.1 
 
 		 393 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  50.58 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  50.58 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  50.58 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  49.58 
 
 		 400 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>