276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4182 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
360 aa  743    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.45 
 
 
388 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.86 
 
 
382 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.09 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.79 
 
 
349 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  39.83 
 
 
392 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  39.37 
 
 
385 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  39.78 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  38.31 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  40.51 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 
362 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  40.76 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39.02 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  39.66 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39.38 
 
 
373 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  40.74 
 
 
354 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  41.95 
 
 
347 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.31 
 
 
355 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  40.29 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.24 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  41.82 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.17 
 
 
357 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.24 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.29 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  40.19 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  37.71 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  41.04 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  40.06 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  38.99 
 
 
370 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.94 
 
 
398 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  35.71 
 
 
379 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  38.81 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  39.37 
 
 
389 aa  232  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 
356 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  39.89 
 
 
357 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.29 
 
 
407 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  41.53 
 
 
363 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.39 
 
 
379 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  39.94 
 
 
348 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  37.43 
 
 
354 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  39.18 
 
 
366 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  39.66 
 
 
348 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
343 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.06 
 
 
372 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 
354 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  35.14 
 
 
379 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  41.25 
 
 
356 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  37.75 
 
 
385 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 
354 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  38.24 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  35.45 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  39.14 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.6 
 
 
354 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  34.86 
 
 
379 aa  225  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.38 
 
 
348 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  38.06 
 
 
315 aa  225  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.77 
 
 
391 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  35.47 
 
 
379 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
379 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
379 aa  225  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
379 aa  225  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  35.47 
 
 
379 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
379 aa  225  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 
393 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
379 aa  225  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.62 
 
 
400 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  42.23 
 
 
347 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.82 
 
 
397 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  36.77 
 
 
369 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  35.8 
 
 
379 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.84 
 
 
361 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  38.55 
 
 
362 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  37.88 
 
 
354 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  39.2 
 
 
351 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
384 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
384 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
384 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
384 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
384 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  36.59 
 
 
393 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.41 
 
 
395 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  35.2 
 
 
379 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  41.72 
 
 
343 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  38.51 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  38.53 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  43.62 
 
 
353 aa  222  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.18 
 
 
357 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  37.69 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.29 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  35.2 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  37.57 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  39.15 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.85 
 
 
393 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  37.04 
 
 
363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.06 
 
 
400 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.03 
 
 
398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 
366 aa  219  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  35.18 
 
 
398 aa  219  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  37.75 
 
 
372 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.82 
 
 
375 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>