283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3682 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 366 aa  746    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  63.41 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  59.44 
 
 		 393 aa  431  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  62.08 
 
 		 385 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.32 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  59.83 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  59.83 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  60.56 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  65.92 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  59.44 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.8 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  59.94 
 
 		 385 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  63.77 
 
 		 383 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  59.38 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  62.5 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  59.59 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  58.11 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  57.22 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  59.08 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  59.82 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.65 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  57.23 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  56.27 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.18 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.32 
 
 		 343 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  64.6 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  60.13 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  59.62 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  57.73 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  59.31 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  57.86 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  57.86 
 
 		 348 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  59.7 
 
 		 353 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  58.8 
 
 		 343 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.19 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  56.56 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  57.14 
 
 		 350 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  48.3 
 
 		 373 aa  296  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  47.11 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  47.8 
 
 		 363 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  45.54 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  42.94 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  44.02 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  46.48 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  46.45 
 
 		 387 aa  279  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  44.09 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  44.27 
 
 		 356 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  46.42 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  44.51 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  45.26 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  44.48 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  41.59 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.9 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  44.24 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.55 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  44.24 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  43.37 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.69 
 
 		 357 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.04 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  43.77 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.73 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  43.34 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  42.59 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 354 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  45.03 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  44.48 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  45.42 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.35 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  45.42 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.6 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  40.29 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  39.46 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  40 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.65 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  42.81 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.9 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  42.77 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  42.81 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.22 
 
 		 400 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  42.36 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.61 
 
 		 379 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.3 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  39.69 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.38 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.5 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  47.02 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.38 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.14 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.48 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>