266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4582 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  90.65 
 
 
383 aa  715    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 
385 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  74.53 
 
 
387 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  75.89 
 
 
390 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  67.39 
 
 
383 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  64.34 
 
 
393 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  63.34 
 
 
404 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  63.03 
 
 
398 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  62.53 
 
 
392 aa  464  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.52 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.87 
 
 
380 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  59.13 
 
 
392 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.67 
 
 
382 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  62.18 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  59.63 
 
 
385 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  58.04 
 
 
389 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  61.86 
 
 
349 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.81 
 
 
375 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  58.9 
 
 
374 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  59.31 
 
 
363 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  60.11 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  63.24 
 
 
344 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  60.23 
 
 
366 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  58.81 
 
 
372 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  63.16 
 
 
347 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  58.77 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  59.06 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  59.24 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.65 
 
 
343 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  58.89 
 
 
356 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.81 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  60.64 
 
 
357 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  60.24 
 
 
343 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.77 
 
 
349 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  66.77 
 
 
325 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  64.07 
 
 
353 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  57.77 
 
 
350 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  47.25 
 
 
363 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  44.15 
 
 
387 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  47.46 
 
 
438 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  46.36 
 
 
380 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.1 
 
 
355 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  45.43 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.43 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  43.03 
 
 
356 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  42.05 
 
 
377 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.06 
 
 
373 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  42.69 
 
 
362 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  44.73 
 
 
385 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  42.65 
 
 
354 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  42.69 
 
 
362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.35 
 
 
361 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  42.73 
 
 
362 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.42 
 
 
332 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  41.11 
 
 
355 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  41.94 
 
 
360 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.63 
 
 
364 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  42.27 
 
 
359 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.17 
 
 
361 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  41.06 
 
 
385 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  42.63 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 
369 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.4 
 
 
348 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  40.88 
 
 
383 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.25 
 
 
362 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  40.72 
 
 
393 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  41.16 
 
 
379 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  41.64 
 
 
351 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 
386 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.24 
 
 
357 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  38.73 
 
 
379 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  40.78 
 
 
360 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  39.79 
 
 
382 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.44 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  39.79 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  42.2 
 
 
372 aa  252  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  40.44 
 
 
404 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 
354 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  41.41 
 
 
366 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.95 
 
 
354 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.52 
 
 
382 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 
354 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  38.99 
 
 
411 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  39.68 
 
 
411 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.45 
 
 
368 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.22 
 
 
338 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.77 
 
 
354 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  38.23 
 
 
379 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 
397 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0521  iron-sulfur cluster binding protein  39.52 
 
 
430 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585197  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  41.32 
 
 
370 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  42.9 
 
 
354 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  39.94 
 
 
379 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  36.63 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  36.63 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  36.63 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  36.63 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  36.63 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  36.63 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  36.63 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>