256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1627 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  800    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  43.5 
 
 
393 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  46.11 
 
 
374 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.25 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.65 
 
 
375 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.66 
 
 
382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.65 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.53 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  41.27 
 
 
398 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  44.16 
 
 
383 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  43.27 
 
 
383 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  43.78 
 
 
385 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  44.6 
 
 
392 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  45.15 
 
 
390 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  44.15 
 
 
385 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  44.02 
 
 
389 aa  289  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  43.2 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  43.11 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  45 
 
 
357 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  44.08 
 
 
387 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  46.45 
 
 
366 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  41.1 
 
 
392 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  49.49 
 
 
353 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  46.27 
 
 
325 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.15 
 
 
355 aa  275  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.14 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  44.01 
 
 
347 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  46.93 
 
 
350 aa  272  9e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  41.52 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.35 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  42.31 
 
 
349 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  42.51 
 
 
363 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 
357 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.41 
 
 
384 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.41 
 
 
384 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 
384 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 
384 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 
384 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  39.43 
 
 
379 aa  266  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  39.43 
 
 
379 aa  265  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  42.82 
 
 
363 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  42.73 
 
 
344 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.11 
 
 
357 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.79 
 
 
386 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  41.57 
 
 
356 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.4 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  38.89 
 
 
379 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
379 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
379 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
379 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  38.89 
 
 
379 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
379 aa  259  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
379 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  39.71 
 
 
368 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.34 
 
 
379 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 
379 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 
397 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 
362 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  40.41 
 
 
380 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
379 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.35 
 
 
373 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  39.94 
 
 
379 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.94 
 
 
343 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  37.07 
 
 
375 aa  255  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  42.56 
 
 
347 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  41.87 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  36.75 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  41.35 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  40.47 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  41.45 
 
 
354 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  40.95 
 
 
354 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  39.94 
 
 
354 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  40.06 
 
 
372 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  38.22 
 
 
369 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  39.94 
 
 
377 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  36.71 
 
 
369 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39.59 
 
 
355 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.43 
 
 
379 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  43.41 
 
 
348 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.65 
 
 
354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  39.77 
 
 
362 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 
354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  40.7 
 
 
361 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  43.09 
 
 
348 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 
380 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.54 
 
 
364 aa  247  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.66 
 
 
361 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  39.77 
 
 
362 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  38.97 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  39.31 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  38.24 
 
 
362 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  37.7 
 
 
383 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 
354 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  35.12 
 
 
411 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  39.61 
 
 
393 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  35.12 
 
 
411 aa  243  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  39.94 
 
 
356 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  41.51 
 
 
326 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  41.88 
 
 
366 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  37.01 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>