270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2784 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  89.77 
 
 		 348 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  90.06 
 
 		 348 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  78.27 
 
 		 347 aa  534  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  73.02 
 
 		 344 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  71.09 
 
 		 343 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  70.45 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  66.56 
 
 		 380 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  65.75 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  61.58 
 
 		 393 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  65 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  65.09 
 
 		 383 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  59 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  59.29 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.88 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  63.1 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  64.2 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  60.88 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.64 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  62.83 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  61.11 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  60.59 
 
 		 383 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  61.77 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  59.12 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  65.57 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  59.28 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.7 
 
 		 375 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  61.83 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  63.58 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  57.59 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  67.96 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  59.77 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  58.26 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  59.71 
 
 		 382 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  61.88 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  58.73 
 
 		 366 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  63.91 
 
 		 353 aa  350  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  46.63 
 
 		 368 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  48.08 
 
 		 363 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  48.53 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  46.94 
 
 		 438 aa  278  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.87 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.04 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.53 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  45.51 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  42.74 
 
 		 369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  45.02 
 
 		 385 aa  268  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  46.05 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  49.51 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  44.94 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  43.81 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  43.09 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  41.81 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  46.46 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  43.5 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.28 
 
 		 400 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  44.48 
 
 		 372 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  43.27 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  45.45 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  42.68 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  40.92 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.28 
 
 		 395 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.14 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.06 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.34 
 
 		 379 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  44.94 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  44.78 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.34 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.27 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.69 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  42.06 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.2 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  45.99 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.06 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  42.3 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.39 
 
 		 393 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  43.21 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  43.14 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.62 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  41.8 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  41.94 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  41.6 
 
 		 411 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.19 
 
 		 348 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  42.02 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  42.44 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  42.02 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  42.36 
 
 		 385 aa  248  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  42.04 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  42.66 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  43.06 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  43.41 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.56 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>