279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3598 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  780    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  67.64 
 
 
393 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  68.49 
 
 
398 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  68.77 
 
 
404 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  68.46 
 
 
383 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  65.5 
 
 
387 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  67.39 
 
 
385 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  67.21 
 
 
390 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.07 
 
 
388 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  65.14 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.22 
 
 
380 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  65.14 
 
 
383 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.15 
 
 
382 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  61.35 
 
 
370 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  61.14 
 
 
392 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  60.53 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  64.07 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  63.31 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  62.14 
 
 
363 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  60.66 
 
 
374 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  60.63 
 
 
347 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  58.24 
 
 
372 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.8 
 
 
375 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  61.22 
 
 
356 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  65.93 
 
 
366 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  61.47 
 
 
344 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  66.36 
 
 
325 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  60.55 
 
 
343 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  60.47 
 
 
357 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  59.12 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.12 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  58.82 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.84 
 
 
382 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  60.49 
 
 
347 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.33 
 
 
349 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  63.5 
 
 
353 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  59.48 
 
 
350 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  45.53 
 
 
368 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.33 
 
 
373 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.74 
 
 
355 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  48.88 
 
 
363 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  46.09 
 
 
438 aa  292  6e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  46.65 
 
 
385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 
355 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  44.99 
 
 
362 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  43.11 
 
 
387 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.94 
 
 
361 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  44.38 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  43.22 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  46.75 
 
 
357 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  41.81 
 
 
379 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  41.98 
 
 
379 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.66 
 
 
364 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  45.35 
 
 
380 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  43.4 
 
 
351 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.99 
 
 
386 aa  278  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.39 
 
 
348 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  42.27 
 
 
355 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.12 
 
 
397 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  43.48 
 
 
356 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.89 
 
 
332 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  43.73 
 
 
354 aa  275  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  44.51 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  43.3 
 
 
385 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.02 
 
 
362 aa  272  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  42.03 
 
 
377 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  40.5 
 
 
372 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  44.48 
 
 
366 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  40.41 
 
 
375 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.2 
 
 
338 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  42.94 
 
 
349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  42.81 
 
 
373 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  42.98 
 
 
361 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  42.74 
 
 
360 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  43.35 
 
 
383 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  41.01 
 
 
370 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  41.18 
 
 
379 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  41.47 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  41.77 
 
 
379 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.78 
 
 
379 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  40.85 
 
 
379 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  40.85 
 
 
379 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 
379 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  41.81 
 
 
361 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  39.6 
 
 
375 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.06 
 
 
379 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.5 
 
 
393 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  41.77 
 
 
408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  41.74 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.5 
 
 
391 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  43.45 
 
 
362 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  43.45 
 
 
362 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.39 
 
 
359 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 
384 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>