281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2385 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  92.26 
 
 		 356 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  96.56 
 
 		 392 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  72.86 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  69.35 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  64.07 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  61.18 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.78 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  60.61 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  60.3 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.99 
 
 		 380 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  60.36 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  60.96 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  57.96 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  58.88 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  60.42 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.33 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  60.36 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  58.77 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  58.11 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  63.84 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  57.52 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  60 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  63.93 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  66.1 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  62.54 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.28 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  62.84 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  56.19 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  62.14 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  63.52 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  65.25 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  61.17 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  61.49 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.93 
 
 		 349 aa  362  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  60.12 
 
 		 382 aa  359  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  60.46 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.05 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  45.16 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  42.31 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  45.21 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  45.81 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  45.39 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.26 
 
 		 357 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  45.13 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.04 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  43.93 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  44.01 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  44.01 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.08 
 
 		 362 aa  255  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.3 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  47.52 
 
 		 393 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  41.69 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  42.22 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  44.83 
 
 		 377 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.91 
 
 		 386 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.9 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  42.59 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  42.67 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.2 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  41.8 
 
 		 398 aa  245  8e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  44.93 
 
 		 366 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  38.71 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  43 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  42.43 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  44.64 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  43 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.07 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  42.77 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  44.98 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  42.02 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  43.51 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.18 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  39.56 
 
 		 379 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.5 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  42.17 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.37 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  41.82 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  45.85 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  41.94 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  37.5 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  41.16 
 
 		 354 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  40.82 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  41.94 
 
 		 408 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.82 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.42 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 382 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  40.64 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  40.51 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  41.33 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.51 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.39 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.08 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  41.81 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.87 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  40.6 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  38.61 
 
 		 405 aa  232  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  40.87 
 
 		 411 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  41.12 
 
 		 360 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  37.62 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>