273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3042 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  790    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.46 
 
 
388 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  43.39 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  43.2 
 
 
385 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.84 
 
 
362 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.55 
 
 
355 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.7 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  40.55 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.03 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.2 
 
 
349 aa  252  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  40.27 
 
 
374 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  42.48 
 
 
370 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  37.7 
 
 
387 aa  250  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  40.2 
 
 
445 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  38.59 
 
 
393 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  42.41 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  43.08 
 
 
343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.77 
 
 
382 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  37.7 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  41.08 
 
 
348 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  41.19 
 
 
348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  42.31 
 
 
347 aa  242  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 
326 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.16 
 
 
382 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
392 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  38.27 
 
 
383 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.91 
 
 
361 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.23 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  38.71 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  41.67 
 
 
344 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  39.26 
 
 
354 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 
354 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 
361 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  38.76 
 
 
359 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.14 
 
 
360 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  38.59 
 
 
383 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.68 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  40.64 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  39.66 
 
 
362 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  39.1 
 
 
392 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.68 
 
 
354 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.37 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  39.26 
 
 
362 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  40.59 
 
 
363 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  36.68 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.92 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  39.78 
 
 
380 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.19 
 
 
398 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  42.06 
 
 
366 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  41.16 
 
 
347 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  38.33 
 
 
408 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  38.07 
 
 
369 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
308 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.92 
 
 
404 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  40.06 
 
 
389 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  42.53 
 
 
380 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.54 
 
 
373 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  38.9 
 
 
368 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  38.36 
 
 
404 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  40.53 
 
 
356 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.12 
 
 
355 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  37.46 
 
 
323 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  42.53 
 
 
350 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  41.06 
 
 
366 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  38.95 
 
 
374 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  41.5 
 
 
357 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.46 
 
 
372 aa  224  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  40.63 
 
 
312 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.09 
 
 
357 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  39.64 
 
 
312 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  38.98 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  37.86 
 
 
324 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  39.54 
 
 
379 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  37.54 
 
 
355 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  38.02 
 
 
379 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
379 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
379 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  38.02 
 
 
379 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
379 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
379 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
379 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  39.41 
 
 
306 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  38.62 
 
 
385 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 
379 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.16 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.16 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.16 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.16 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.16 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  39.14 
 
 
354 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  39.48 
 
 
356 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  38.19 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  43.52 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  36.03 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  36.96 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  36.58 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  37.53 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  37.84 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>