255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3940 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 445 aa  862    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  41.93 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  40.93 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  37.14 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  41.15 
 
 		 383 aa  246  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.86 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.86 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  42.27 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.35 
 
 		 355 aa  239  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  38.85 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  39.43 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  41.22 
 
 		 349 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  40.39 
 
 		 380 aa  230  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.51 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  40.53 
 
 		 383 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.43 
 
 		 361 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  40.05 
 
 		 347 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  40.53 
 
 		 356 aa  226  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.78 
 
 		 357 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  38.04 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  36.46 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  42 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.76 
 
 		 373 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  40.88 
 
 		 344 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  40.1 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  41.02 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.99 
 
 		 372 aa  223  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  39.43 
 
 		 361 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.23 
 
 		 332 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  39.13 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.06 
 
 		 384 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.06 
 
 		 384 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.06 
 
 		 384 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.12 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  40.94 
 
 		 348 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  41.85 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  40.68 
 
 		 348 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.52 
 
 		 361 aa  220  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.61 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  40 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  36.45 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  39.57 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.03 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  40.64 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.99 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  38.73 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.34 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  37.79 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  41.44 
 
 		 372 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.17 
 
 		 379 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.34 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.17 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  39.28 
 
 		 354 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  39.13 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  40.5 
 
 		 385 aa  216  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.69 
 
 		 386 aa  216  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  36.91 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  40.64 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.52 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  37.7 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 379 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  38.1 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  40.76 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.2 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.35 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  37.7 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  37.98 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  37.04 
 
 		 359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.77 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.62 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  41.31 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  41.03 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.52 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0521  iron-sulfur cluster binding protein  38.38 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 354 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  39.9 
 
 		 414 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  38.4 
 
 		 354 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.97 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  38.38 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.9 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.65 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1131  iron-sulfur cluster binding protein  39.9 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.264081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  38.24 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  36.51 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  41.18 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.68 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  37.2 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.67 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  37.2 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.01 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  38.25 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>