286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4975 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 315 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  71.71 
 
 		 308 aa  474  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  63.67 
 
 		 308 aa  421  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  64.14 
 
 		 309 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  60.33 
 
 		 312 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  57.88 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  58.86 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  55.87 
 
 		 326 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  41 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  43.22 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.89 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  44.12 
 
 		 362 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  43.67 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.4 
 
 		 386 aa  248  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  42.24 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  41.58 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  41.58 
 
 		 311 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  42.54 
 
 		 354 aa  245  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.4 
 
 		 359 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  41.9 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  42.9 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.38 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  40.79 
 
 		 323 aa  242  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  43.04 
 
 		 379 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  40.13 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  40.69 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  39.75 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  40.59 
 
 		 380 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  42.22 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  42.72 
 
 		 379 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.29 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  42.38 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  40.19 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.78 
 
 		 364 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 		 351 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 		 379 aa  238  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.97 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  40.19 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  40.63 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  41.72 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  41.72 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  39.53 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  42.05 
 
 		 355 aa  235  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 354 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  41.53 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.13 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  41.48 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  42.16 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.56 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  40.74 
 
 		 409 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.74 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  40.06 
 
 		 382 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.74 
 
 		 409 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.74 
 
 		 409 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 409 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 409 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 409 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  39.4 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  41.06 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.81 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  38.87 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.06 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  38.66 
 
 		 385 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  39.63 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  40.06 
 
 		 411 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.4 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  39.6 
 
 		 356 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  39.45 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  37.95 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  39.32 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  39.3 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39.33 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 411 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  39.14 
 
 		 369 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.07 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.4 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  39.26 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  38.71 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.06 
 
 		 360 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  37.42 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.87 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  38.34 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.82 
 
 		 407 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  39.09 
 
 		 393 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.52 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  39.42 
 
 		 370 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.66 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>