More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0472 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  100 
 
 		 331 aa  677    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  43.93 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  43.43 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  42.01 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  39.87 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.4 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  45.08 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  45.08 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  43.73 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  45.6 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  45.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  45.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  45.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  45.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  45.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  45.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  45.25 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  44.86 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.37 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.18 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  43.65 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  44.55 
 
 		 354 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  44.94 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  44.16 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  44.09 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.35 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  43.55 
 
 		 375 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  42.35 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  41.85 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.9 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.33 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 		 379 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  42.12 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 384 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  42.9 
 
 		 385 aa  235  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 		 384 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  40.13 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  42.21 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  41.19 
 
 		 380 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  43.45 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.69 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.13 
 
 		 379 aa  232  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  41.91 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  41.67 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.72 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  41.33 
 
 		 362 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  42.76 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  40.26 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  41.14 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  42.12 
 
 		 438 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.81 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  41.16 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  38.92 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  39.75 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  42.43 
 
 		 373 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  40.84 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  41.5 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  40.2 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  39.1 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  44.23 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  41.04 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  40.33 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  40.32 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  41.31 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.74 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.45 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  40.75 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  39.41 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  42.01 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  40.13 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.35 
 
 		 375 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  40.62 
 
 		 349 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.46 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  42.11 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  38.1 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.42 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  37.9 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  39.42 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  39.29 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  37.46 
 
 		 393 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  38.73 
 
 		 398 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  37.01 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  39.58 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1131  iron-sulfur cluster binding protein  40.82 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.264081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  39.41 
 
 		 374 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>