280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1644 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  74.43 
 
 
309 aa  493  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  67.21 
 
 
312 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  65.45 
 
 
308 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  63.67 
 
 
315 aa  421  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  59.8 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  57.95 
 
 
314 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  51.96 
 
 
326 aa  349  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.05 
 
 
357 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39.87 
 
 
331 aa  256  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  40.51 
 
 
362 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  41.67 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  41.39 
 
 
354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.39 
 
 
359 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.4 
 
 
354 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.65 
 
 
354 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  38.67 
 
 
347 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.25 
 
 
386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  40.73 
 
 
354 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.74 
 
 
361 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  39.62 
 
 
354 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  39.07 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 
362 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  41.12 
 
 
368 aa  241  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  39.09 
 
 
320 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  41.28 
 
 
380 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  38.56 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  39.22 
 
 
379 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  39.13 
 
 
380 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  39.22 
 
 
379 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.87 
 
 
379 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  40.06 
 
 
363 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  39.53 
 
 
324 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  39.13 
 
 
323 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  37.7 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.33 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.8 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  38.72 
 
 
306 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  38.49 
 
 
312 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.33 
 
 
397 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.8 
 
 
355 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.38 
 
 
343 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  39.27 
 
 
317 aa  231  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  38.38 
 
 
345 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  39.8 
 
 
314 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  38.05 
 
 
343 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  39.13 
 
 
438 aa  228  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  37.1 
 
 
374 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.61 
 
 
384 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  38.21 
 
 
311 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.61 
 
 
384 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  37.58 
 
 
379 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 
379 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 
379 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.28 
 
 
384 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  37.58 
 
 
379 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.05 
 
 
375 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 
379 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.28 
 
 
384 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 
379 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.75 
 
 
364 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 
379 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.28 
 
 
384 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  38.21 
 
 
311 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.34 
 
 
388 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  37.42 
 
 
355 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  37.21 
 
 
379 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  36.69 
 
 
393 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.33 
 
 
349 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  37.25 
 
 
379 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.8 
 
 
355 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.58 
 
 
379 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  38.08 
 
 
385 aa  223  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.46 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  36.12 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  38.8 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  35.14 
 
 
411 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  35.14 
 
 
411 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  37.21 
 
 
380 aa  218  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  36.36 
 
 
370 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  37.58 
 
 
398 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  37.86 
 
 
375 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  36.18 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  36.72 
 
 
362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 
361 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  36.18 
 
 
372 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  38.21 
 
 
356 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  34.19 
 
 
385 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  35.96 
 
 
398 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  39.29 
 
 
398 aa  215  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  37.1 
 
 
369 aa  215  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  37.92 
 
 
374 aa  215  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  38.72 
 
 
350 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00061  hypothetical protein  34.54 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.98 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.31 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  36.77 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0007  hypothetical protein  38.73 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  36.33 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>