279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0255 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
320 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  62.42 
 
 
324 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  57.76 
 
 
335 aa  362  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  53.33 
 
 
320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  55.41 
 
 
314 aa  345  6e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  49.19 
 
 
314 aa  309  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  46.03 
 
 
318 aa  272  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  41.18 
 
 
312 aa  245  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  39.09 
 
 
308 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.31 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  41.14 
 
 
331 aa  229  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
326 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  37.42 
 
 
308 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  40.07 
 
 
347 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  39.48 
 
 
363 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  38.11 
 
 
361 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.46 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.11 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.21 
 
 
362 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  38.21 
 
 
362 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  37.79 
 
 
315 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  40.13 
 
 
343 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  40.13 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.83 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.42 
 
 
398 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.42 
 
 
404 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  39.27 
 
 
380 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 
354 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  36.54 
 
 
359 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  36.74 
 
 
379 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  36.66 
 
 
354 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  41.22 
 
 
354 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  35.43 
 
 
393 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
382 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  37.79 
 
 
374 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  36.08 
 
 
415 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  37.46 
 
 
383 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  38.28 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  37.62 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.05 
 
 
357 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  37.3 
 
 
380 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  35.69 
 
 
354 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
384 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
384 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
384 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
384 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
384 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.94 
 
 
379 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  36.42 
 
 
379 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.37 
 
 
354 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.04 
 
 
380 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.62 
 
 
354 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  35.97 
 
 
385 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 
362 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.33 
 
 
373 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  36.12 
 
 
387 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
397 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  35.33 
 
 
404 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  36.09 
 
 
355 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  37.06 
 
 
438 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.54 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  35.69 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.33 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  35.83 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  34.87 
 
 
383 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  37.18 
 
 
372 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  36.84 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  36.62 
 
 
372 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
400 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
395 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.93 
 
 
379 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  36.45 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  36.13 
 
 
379 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  35.95 
 
 
369 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  36.51 
 
 
379 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.22 
 
 
349 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.14 
 
 
400 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  35.6 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  35.6 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  35.6 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  35.6 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  35.6 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  35.6 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  35.6 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  35.62 
 
 
375 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.99 
 
 
398 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  35.69 
 
 
409 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.14 
 
 
400 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.63 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  35.02 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  34.4 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  34.4 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  35.6 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.69 
 
 
409 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.69 
 
 
409 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.69 
 
 
409 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>