256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1748 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 335 aa  685    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  58.51 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  59.28 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  57.76 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  57.65 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  54.78 
 
 		 314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  52.26 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  38.49 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  41.16 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  38.64 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.54 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  38.21 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  38.05 
 
 		 314 aa  209  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  38.46 
 
 		 347 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  35.71 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  36.07 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.6 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.54 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  39.6 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  40.27 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  39.81 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  33.99 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  36.59 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  37.22 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  38.25 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 		 391 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  36.39 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  37.11 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  37.22 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  38.85 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.59 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  36.05 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  37.19 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  36.62 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.89 
 
 		 393 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  37.94 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.31 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.39 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.1 
 
 		 382 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 		 384 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 		 384 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 		 384 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  36.49 
 
 		 393 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.23 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.65 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.97 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.18 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  35.39 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  34.75 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  38.04 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.06 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.18 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  37.54 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  35.56 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.01 
 
 		 382 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  35.94 
 
 		 415 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.61 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  36.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  36.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.16 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  36.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  33.55 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  36.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  36.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  36.01 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  36.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  38.91 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.08 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  36.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  36.94 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.74 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.67 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  37.42 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  38.22 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.38 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.86 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.27 
 
 		 398 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  34.45 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  36.13 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  36.69 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  37.9 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  37.42 
 
 		 380 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  35.57 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  35.19 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.27 
 
 		 404 aa  175  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.35 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  34.19 
 
 		 404 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  36.26 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  31.63 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.83 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.05 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  35.05 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.05 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.05 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.5 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  33.77 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.05 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.05 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>