276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1139 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 
365 aa  739    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  68.22 
 
 
385 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1978  hypothetical protein  49.29 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  43.35 
 
 
380 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.06 
 
 
375 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  35.95 
 
 
404 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  35.22 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.74 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.1 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  36.69 
 
 
383 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  38.85 
 
 
350 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  38.91 
 
 
363 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.31 
 
 
404 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  37.62 
 
 
347 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  34.62 
 
 
393 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  38.61 
 
 
389 aa  199  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  37.38 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.01 
 
 
398 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  35.05 
 
 
314 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  35.6 
 
 
326 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.76 
 
 
343 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.19 
 
 
382 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  36.13 
 
 
445 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.79 
 
 
375 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  38.64 
 
 
343 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  35.28 
 
 
385 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.79 
 
 
375 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.11 
 
 
354 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  37.46 
 
 
354 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 
380 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 
354 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  38.44 
 
 
408 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  38.64 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  32.86 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  34.29 
 
 
383 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.94 
 
 
372 aa  189  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  37.04 
 
 
354 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  37.02 
 
 
324 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.94 
 
 
376 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  37.5 
 
 
373 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  33.91 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  36.92 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  36.46 
 
 
331 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  36.8 
 
 
383 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  36.12 
 
 
320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  35.62 
 
 
349 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
380 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
380 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  37.28 
 
 
353 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  34.08 
 
 
385 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  34.59 
 
 
392 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.39 
 
 
355 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.33 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.69 
 
 
380 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  34.69 
 
 
380 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  34.69 
 
 
380 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
380 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
380 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  32.42 
 
 
363 aa  180  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  35.42 
 
 
392 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  34.94 
 
 
356 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.65 
 
 
380 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  34.02 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.82 
 
 
357 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
380 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
380 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.09 
 
 
380 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.03 
 
 
380 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  35.81 
 
 
335 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.56 
 
 
388 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  33.23 
 
 
383 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.91 
 
 
362 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  34.94 
 
 
318 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  35.06 
 
 
374 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.94 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  33.82 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  34.57 
 
 
372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  34.89 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.33 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  33 
 
 
311 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  32.97 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  33.44 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  31.58 
 
 
379 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
379 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.54 
 
 
382 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.3 
 
 
343 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  31.58 
 
 
379 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
379 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
379 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
379 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
379 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  33.92 
 
 
347 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.92 
 
 
379 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  31.64 
 
 
369 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  33.53 
 
 
344 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  32.93 
 
 
347 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  34.01 
 
 
348 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>