289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0440 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 
353 aa  715    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  37.76 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.24 
 
 
375 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  41.29 
 
 
372 aa  238  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  41.55 
 
 
351 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  38.92 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  40.53 
 
 
379 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 
379 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 
379 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 
379 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  40.53 
 
 
379 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 
379 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 
379 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  39.14 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  38.02 
 
 
385 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  39.83 
 
 
385 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  38.86 
 
 
385 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.46 
 
 
348 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
379 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  39.94 
 
 
379 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  40.24 
 
 
379 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.99 
 
 
398 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  38.08 
 
 
354 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  38.18 
 
 
372 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  39.71 
 
 
362 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.99 
 
 
404 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.4 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.4 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.4 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.4 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.4 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 
354 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  39.07 
 
 
347 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  39.54 
 
 
368 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
360 aa  226  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  37.71 
 
 
392 aa  225  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.55 
 
 
349 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.51 
 
 
388 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.83 
 
 
361 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  38.19 
 
 
347 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.12 
 
 
362 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 
390 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  36.87 
 
 
369 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.6 
 
 
361 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.37 
 
 
380 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  39.52 
 
 
379 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  39.05 
 
 
379 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  39.76 
 
 
379 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  37.9 
 
 
383 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  38.92 
 
 
362 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  39.52 
 
 
363 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.17 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.92 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.37 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  36.31 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.26 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  40.52 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  38.59 
 
 
373 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  38.79 
 
 
379 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  37.82 
 
 
359 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  36.95 
 
 
369 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  37.86 
 
 
383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  38.3 
 
 
355 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  37.91 
 
 
375 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  37.54 
 
 
404 aa  219  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  39.83 
 
 
361 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  36.66 
 
 
380 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.92 
 
 
379 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  39.12 
 
 
356 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.88 
 
 
332 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  37.99 
 
 
366 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  37.92 
 
 
375 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  36.99 
 
 
389 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  39.23 
 
 
344 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  39.29 
 
 
349 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.5 
 
 
372 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  37.86 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  38.51 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  37.94 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  38.02 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.13 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  36.94 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  37.36 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3197  4Fe-4S cluster binding  39.81 
 
 
370 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  37.03 
 
 
387 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.99 
 
 
354 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  37.32 
 
 
398 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  37.6 
 
 
408 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  37.46 
 
 
355 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  37.57 
 
 
380 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.46 
 
 
360 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  38.67 
 
 
356 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  37.64 
 
 
385 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  36.39 
 
 
398 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  38.55 
 
 
354 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.82 
 
 
354 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.36 
 
 
428 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 
357 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  37.78 
 
 
354 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  36.59 
 
 
377 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>