263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1978 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  785    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  48.31 
 
 		 385 aa  322  8e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  50.31 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  37.08 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  37.46 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  39.77 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  35.92 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  41.91 
 
 		 347 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  38.52 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.21 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  37.75 
 
 		 445 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  36.62 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.48 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  39.22 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.95 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  38.68 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  35.78 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  39.55 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  41.75 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  34.92 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  39.19 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.18 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.52 
 
 		 343 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  32.23 
 
 		 312 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.24 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.38 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.38 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  35.95 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  37.38 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.77 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  41.42 
 
 		 345 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  36.36 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.36 
 
 		 361 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.53 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  32.26 
 
 		 308 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.14 
 
 		 362 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  38.56 
 
 		 363 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.96 
 
 		 398 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  37.01 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.53 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  35.69 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  35.92 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  36.57 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  32.58 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  33.8 
 
 		 383 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  31.99 
 
 		 375 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.49 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  37.99 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.28 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.67 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  34.5 
 
 		 390 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.5 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  34.5 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  34.73 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.03 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  34.84 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.29 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  34.7 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  31.41 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  33.72 
 
 		 359 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  32.58 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  34.32 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  35.83 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  36.36 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  35.82 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  31 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.62 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  36.86 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  32.42 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  32.72 
 
 		 372 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  33.85 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.67 
 
 		 355 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  32.24 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  32.15 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  31.23 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  37.2 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  34.16 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  30.39 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  33.52 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  33.33 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  36.36 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  35 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  32.56 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  37.5 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 379 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  35.69 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  29.94 
 
 		 369 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  32.27 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  36.94 
 
 		 348 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  32.27 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  36.28 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  35.14 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>