134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1581 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  747    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.59 
 
 
354 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1147  hypothetical protein  52.15 
 
 
352 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0295798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.25 
 
 
349 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  28.92 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.42 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.49 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.6 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.6 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.6 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.89 
 
 
450 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.66 
 
 
263 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.08 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  26.42 
 
 
507 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  41.43 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  25.98 
 
 
229 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.19 
 
 
262 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.02 
 
 
231 aa  59.3  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  23.56 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.74 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  24.78 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  25.15 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  41.79 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  27.59 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.13 
 
 
233 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  33.02 
 
 
550 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  25.75 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  30.38 
 
 
261 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.86 
 
 
251 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  57  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  25.65 
 
 
182 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.14 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  28.14 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  28.14 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.14 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.14 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  38.24 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.54 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.8 
 
 
268 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.48 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  25 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.21 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  27.59 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.76 
 
 
238 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.14 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.14 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.71 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.62 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.54 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.51 
 
 
247 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.23 
 
 
450 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.71 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  27.54 
 
 
380 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  27.54 
 
 
380 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.82 
 
 
404 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.82 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  34.29 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.36 
 
 
227 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.92 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  37.31 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  38.46 
 
 
387 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  31.34 
 
 
385 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.88 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  26.71 
 
 
389 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  32.35 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.98 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  25.35 
 
 
317 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  35.38 
 
 
393 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0493  protein of unknown function DUF1730  35.82 
 
 
404 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  32.84 
 
 
383 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  25 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  32.84 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.43 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  40.68 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  26.8 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  34.25 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  35.82 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  32.88 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  33.72 
 
 
514 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  33.72 
 
 
514 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  25.89 
 
 
247 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.53 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  29.17 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  20.5 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  25 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  26.78 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  24.48 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  24.48 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  33.82 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.59 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  32.86 
 
 
312 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00061  hypothetical protein  31.08 
 
 
318 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  34.33 
 
 
364 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  22.96 
 
 
356 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  31.34 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  27.93 
 
 
330 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.01 
 
 
236 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  29.41 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  22.22 
 
 
349 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  32.86 
 
 
380 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>