254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2669 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
450 aa  941    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.56 
 
 
445 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.21 
 
 
450 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.15 
 
 
450 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.19 
 
 
442 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.18 
 
 
343 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  59.24 
 
 
344 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.24 
 
 
344 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.24 
 
 
344 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.22 
 
 
282 aa  67  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.8 
 
 
233 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  28.71 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.72 
 
 
229 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  37.76 
 
 
318 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  28.1 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  25.69 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  28.48 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  28.1 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.49 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  33.65 
 
 
383 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  37.62 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  37.89 
 
 
347 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  33.66 
 
 
393 aa  61.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  34.83 
 
 
390 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  37.08 
 
 
348 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  37.08 
 
 
348 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.8 
 
 
354 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  35.37 
 
 
404 aa  60.1  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  33.71 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  25.12 
 
 
314 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  24.66 
 
 
383 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  33.05 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.27 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  32.69 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  35.37 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.96 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  34.83 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.59 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.88 
 
 
227 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.37 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2788  hypothetical protein  50.98 
 
 
317 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.65 
 
 
233 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.37 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  36.59 
 
 
314 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  22.55 
 
 
323 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.44 
 
 
382 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  24.89 
 
 
379 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.28 
 
 
268 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  33.71 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.96 
 
 
309 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  33.71 
 
 
375 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.74 
 
 
372 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.82 
 
 
386 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  34.83 
 
 
383 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  25.75 
 
 
374 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.59 
 
 
263 aa  57  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  25.26 
 
 
379 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  27.97 
 
 
315 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.85 
 
 
343 aa  56.6  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.26 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.51 
 
 
331 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  33.71 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  34.15 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  27.12 
 
 
312 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  32.58 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  32.58 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.23 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  34.15 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  23.4 
 
 
366 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  35.96 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.11 
 
 
226 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  35.79 
 
 
345 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  26.52 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  25.97 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  24.74 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  24.74 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  27.18 
 
 
261 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  36.84 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  31.62 
 
 
308 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  24.74 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  24.74 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  24.74 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  24.74 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  32.1 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  24.74 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  28.48 
 
 
356 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  35.79 
 
 
343 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  30.86 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  32.1 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  25.19 
 
 
325 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.91 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.91 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.3 
 
 
287 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  32.91 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  32.91 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  32.91 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.91 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>