101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0599 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  67.62 
 
 
261 aa  358  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.39 
 
 
251 aa  214  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
262 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  35.83 
 
 
275 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  37.7 
 
 
267 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  38.31 
 
 
265 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.25 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  35.86 
 
 
261 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.84 
 
 
238 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.87 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.4 
 
 
259 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.45 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  32.48 
 
 
275 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  33.88 
 
 
277 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.32 
 
 
290 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.34 
 
 
311 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.97 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  30.34 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  30.86 
 
 
273 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.4 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.22 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.93 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.86 
 
 
445 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  35.07 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  29.35 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.53 
 
 
282 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.63 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  30.59 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.58 
 
 
450 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.55 
 
 
450 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.65 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.13 
 
 
376 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.94 
 
 
442 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.52 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.63 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  26.14 
 
 
362 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  26.14 
 
 
362 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  25.89 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.03 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.21 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  28.91 
 
 
335 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  25.52 
 
 
364 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  25.54 
 
 
405 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.73 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  23.97 
 
 
405 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  23.95 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  23.95 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  27.14 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.21 
 
 
380 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  25.21 
 
 
380 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  25.21 
 
 
380 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.21 
 
 
380 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.21 
 
 
380 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.21 
 
 
380 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.91 
 
 
380 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.68 
 
 
380 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.37 
 
 
450 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  38.3 
 
 
380 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.09 
 
 
361 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  26.44 
 
 
354 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.7 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.32 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.86 
 
 
354 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  26.16 
 
 
361 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.3 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.76 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 
354 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.82 
 
 
398 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  25.45 
 
 
380 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  25.45 
 
 
380 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
411 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
411 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
379 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.51 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  34.52 
 
 
379 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  26.24 
 
 
359 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  25.29 
 
 
354 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.43 
 
 
404 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.27 
 
 
354 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.27 
 
 
344 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.27 
 
 
344 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.27 
 
 
344 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  33.71 
 
 
404 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  36.96 
 
 
372 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  30.77 
 
 
367 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  24.61 
 
 
380 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2545  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.08 
 
 
375 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00348974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.23 
 
 
369 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  25.23 
 
 
389 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  23.74 
 
 
455 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  23.74 
 
 
455 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  30.2 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  26.16 
 
 
308 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  36.47 
 
 
445 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>