32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0122 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 		 285 aa  590  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.48 
 
 		 311 aa  258  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.29 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  41.28 
 
 		 273 aa  205  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  40.97 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  43.06 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.93 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.21 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  33.46 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  29.09 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  29.09 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  28.16 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.1 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  26.39 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  28.73 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  28.24 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.74 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.11 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.35 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.32 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  27.39 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  24.22 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 354 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1527  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23.14 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000239897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  30 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  28.23 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>