69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0807 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  80.74 
 
 
275 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  64.47 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  63.27 
 
 
275 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.83 
 
 
290 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.85 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.61 
 
 
311 aa  228  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.95 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.93 
 
 
285 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  40.32 
 
 
277 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.97 
 
 
262 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.32 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  34.45 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  34.04 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  33.21 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  33.19 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.04 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.52 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 
259 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.71 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.48 
 
 
331 aa  55.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  29.61 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  34.45 
 
 
404 aa  52.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.53 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  27.62 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  28.26 
 
 
354 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  27.48 
 
 
374 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  26.17 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.56 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.22 
 
 
409 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  24.18 
 
 
409 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.29 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  27.85 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  35.09 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  30.68 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  24.3 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.05 
 
 
386 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  27.7 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.05 
 
 
450 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.36 
 
 
380 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.87 
 
 
343 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  26.42 
 
 
380 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  31.11 
 
 
409 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  26.42 
 
 
380 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.33 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  26.42 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.11 
 
 
409 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.42 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.11 
 
 
409 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  26.42 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.42 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.42 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  31.11 
 
 
409 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.11 
 
 
409 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  30 
 
 
353 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.11 
 
 
409 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.51 
 
 
380 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.51 
 
 
380 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0521  iron-sulfur cluster binding protein  31.11 
 
 
430 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  25.69 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  25.93 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.88 
 
 
380 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.9 
 
 
450 aa  42.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.31 
 
 
343 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  23.42 
 
 
357 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  26.92 
 
 
220 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  23.83 
 
 
314 aa  42  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>