36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0774 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  80.74 
 
 		 270 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  64.84 
 
 		 273 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  63.27 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.76 
 
 		 290 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.57 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.6 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.07 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.06 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  40.71 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  33.2 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.6 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  32.77 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  32.48 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  31.49 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  33.21 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.95 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  31.47 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.36 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.11 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  29.89 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  28.7 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  23.21 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.57 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  31.25 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  38.3 
 
 		 658 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  29.27 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  28.16 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  24.89 
 
 		 383 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  28.16 
 
 		 345 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  26.94 
 
 		 398 aa  42.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.74 
 
 		 343 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.29 
 
 		 386 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>