57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0473 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  86.92 
 
 		 265 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  85.44 
 
 		 261 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.26 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  49 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.5 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  39.52 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  42.5 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.25 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  36.4 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  37.25 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  35.51 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.32 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  33.19 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  33.58 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.41 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  29.7 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.67 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.16 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.86 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.8 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.4 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.27 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.67 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.94 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  24.88 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.79 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.4 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  27.55 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  32.22 
 
 		 404 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1147  hypothetical protein  25.6 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0295798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.22 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.65 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 		 362 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.02 
 
 		 355 aa  45.4  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  39.44 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.68 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  27.49 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.1 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.1 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.11 
 
 		 374 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.15 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.15 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  24.26 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.81 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 450 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  38.57 
 
 		 405 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  29.63 
 
 		 392 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  38.57 
 
 		 405 aa  42.4  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  30.86 
 
 		 363 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  27.12 
 
 		 380 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  27.12 
 
 		 380 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>