60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0243 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  92.73 
 
 		 273 aa  530  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  63.27 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  63.27 
 
 		 270 aa  350  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 290 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.07 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.55 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.16 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.62 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  38.05 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.8 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  34.42 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  35.51 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  27.74 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.82 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  30.48 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  30.43 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.1 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.81 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  29.61 
 
 		 330 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  34.34 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.48 
 
 		 450 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  31.63 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 450 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 450 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.36 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  30.81 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  33.33 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  33.06 
 
 		 380 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.57 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  26.94 
 
 		 374 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  30.67 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  29.09 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.08 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  28.65 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  28.65 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.06 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 		 380 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.91 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.21 
 
 		 445 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  28.87 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  31.71 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.91 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.68 
 
 		 343 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 442 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  24.1 
 
 		 405 aa  42.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  32 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  26.92 
 
 		 220 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>