177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4789 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  85.71 
 
 
344 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  85.71 
 
 
344 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  85.71 
 
 
344 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60.18 
 
 
450 aa  438  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.05 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.62 
 
 
445 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.71 
 
 
450 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.99 
 
 
442 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.79 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.9 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  27.08 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.66 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.71 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.17 
 
 
354 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  31.43 
 
 
267 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.32 
 
 
349 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.65 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.29 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  32.58 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.31 
 
 
229 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  31.68 
 
 
393 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.91 
 
 
233 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.35 
 
 
311 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30 
 
 
243 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0493  protein of unknown function DUF1730  30.19 
 
 
404 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  30.83 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  29.32 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  25 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  35.44 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  34.12 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  26.75 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.24 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  32.91 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  34.18 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  27.67 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.24 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  34.18 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  27.34 
 
 
392 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  27.34 
 
 
349 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  26.16 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  29.73 
 
 
331 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  26.05 
 
 
314 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  27.71 
 
 
366 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  32.91 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  36.36 
 
 
385 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.29 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.04 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  27.57 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  25.66 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1147  hypothetical protein  24.72 
 
 
352 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0295798  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.29 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  33.98 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  28.06 
 
 
383 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  31.46 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.34 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  35 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  35 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  33.82 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.25 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.08 
 
 
386 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  34.21 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  32.91 
 
 
404 aa  50.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  22.41 
 
 
405 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  25.9 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  27.34 
 
 
370 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  25.11 
 
 
353 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  38.24 
 
 
308 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  32.35 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.34 
 
 
382 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  25.13 
 
 
261 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  21.9 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  36.76 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.17 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  31.65 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  32.91 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.38 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  26.8 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00061  hypothetical protein  26.43 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  34.41 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.37 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  23.23 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  31.82 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  32.91 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  29.41 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  26.62 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  26.35 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  27.34 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  22.84 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  30.38 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  27.46 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  28.81 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  37.33 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  22.41 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  32.93 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  26.87 
 
 
220 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  27.86 
 
 
317 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  29.7 
 
 
320 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  31.58 
 
 
507 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>