196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2589 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  553  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  32.35 
 
 
182 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.64 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.89 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.1 
 
 
236 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.37 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  28.44 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  28.57 
 
 
229 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.81 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.69 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  30.1 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  25.11 
 
 
389 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  25.22 
 
 
380 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.08 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.16 
 
 
450 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.75 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.48 
 
 
367 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.64 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  29.59 
 
 
352 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 
343 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.85 
 
 
344 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.85 
 
 
344 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.85 
 
 
344 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.23 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  29.35 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.15 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  28.92 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.19 
 
 
380 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.6 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.48 
 
 
386 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.65 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  28.65 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  28.65 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.61 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  24.59 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  27.17 
 
 
404 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.5 
 
 
445 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  26.42 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  26.35 
 
 
383 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.46 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  29.89 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  30.56 
 
 
308 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  41.77 
 
 
321 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  30.82 
 
 
385 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  27.62 
 
 
314 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  27.65 
 
 
347 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  31.82 
 
 
348 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  38.55 
 
 
380 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  38.55 
 
 
380 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  24.78 
 
 
383 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  34.34 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.08 
 
 
247 aa  52.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  32.47 
 
 
343 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  31.17 
 
 
348 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  32.16 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  30.18 
 
 
366 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.89 
 
 
227 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.36 
 
 
442 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 
450 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.25 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  27.01 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.03 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  28.74 
 
 
389 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.84 
 
 
398 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  41.77 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.37 
 
 
404 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  41.43 
 
 
374 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  39.19 
 
 
220 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  38.16 
 
 
404 aa  49.3  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  26.49 
 
 
393 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1382  hypothetical protein  40.24 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.63 
 
 
357 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  36.71 
 
 
320 aa  48.9  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  25.5 
 
 
492 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  37.97 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.43 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  29.76 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.85 
 
 
474 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  37.8 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  26.97 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  37.97 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  24.32 
 
 
492 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  27.18 
 
 
507 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  23.96 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.66 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  32.65 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  25.44 
 
 
377 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.48 
 
 
368 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  29.61 
 
 
320 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.58 
 
 
355 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  39.71 
 
 
314 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  27.96 
 
 
363 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>