84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1382 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1382  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1496  hypothetical protein  38.34 
 
 
218 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.38 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  30.07 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.46 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.88 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.33 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.98 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.82 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.77 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  30.41 
 
 
385 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.88 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.79 
 
 
445 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
226 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.24 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  31.5 
 
 
399 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.99 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  27.49 
 
 
363 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.52 
 
 
362 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.35 
 
 
374 aa  49.7  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  39.39 
 
 
220 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  40.24 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  28.47 
 
 
507 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.42 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.41 
 
 
367 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  26.06 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.03 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.67 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  24.12 
 
 
404 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  27.55 
 
 
359 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  23.38 
 
 
393 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
344 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.26 
 
 
357 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.13 
 
 
344 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  26.53 
 
 
380 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
344 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  39.19 
 
 
314 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  28.49 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  25.49 
 
 
353 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.91 
 
 
450 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  24.5 
 
 
306 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1978  hypothetical protein  24.64 
 
 
397 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.78 
 
 
343 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  25.76 
 
 
349 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  34.78 
 
 
345 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  34.78 
 
 
343 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  25.69 
 
 
323 aa  45.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  37.5 
 
 
550 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.63 
 
 
308 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  26.43 
 
 
365 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  25.76 
 
 
356 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.14 
 
 
387 aa  45.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  27.67 
 
 
311 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  31.48 
 
 
229 aa  45.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  37.14 
 
 
514 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  37.14 
 
 
514 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  25.76 
 
 
392 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  27.67 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  28.28 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.88 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.38 
 
 
372 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  28.47 
 
 
385 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  38.16 
 
 
445 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  27.61 
 
 
364 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  20.12 
 
 
386 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.12 
 
 
398 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  27.53 
 
 
389 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.57 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  27.55 
 
 
362 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  27.08 
 
 
383 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  27.55 
 
 
362 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  22.22 
 
 
380 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  22.81 
 
 
380 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.41 
 
 
355 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  25.25 
 
 
383 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  25.18 
 
 
404 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  27.08 
 
 
390 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  32.43 
 
 
312 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  31.58 
 
 
408 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  30.61 
 
 
320 aa  42.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  30.3 
 
 
314 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.81 
 
 
450 aa  42  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>