233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2004 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
450 aa  929    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.21 
 
 
450 aa  539  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.14 
 
 
450 aa  508  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.12 
 
 
445 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.12 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  59.53 
 
 
344 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.53 
 
 
344 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.53 
 
 
344 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.05 
 
 
343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.05 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  27.89 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.53 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  31.16 
 
 
267 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  25.35 
 
 
507 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  34.34 
 
 
318 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  31.19 
 
 
367 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.65 
 
 
229 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.48 
 
 
386 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  32 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  32.67 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.18 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.63 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.16 
 
 
398 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.86 
 
 
268 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  28.42 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.96 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
263 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  29.35 
 
 
357 aa  57  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  28.92 
 
 
383 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.91 
 
 
233 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.36 
 
 
233 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  33.71 
 
 
343 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.58 
 
 
227 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  32.93 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  25.23 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0493  protein of unknown function DUF1730  32.88 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  32.71 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  34.83 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  31.46 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.96 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  34.83 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.58 
 
 
226 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  34.83 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  27.72 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.75 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  33.75 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  33.75 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  33.75 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.75 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.75 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  33.75 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.59 
 
 
251 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  31 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  30.34 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  32.1 
 
 
380 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  33.71 
 
 
347 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  31.46 
 
 
344 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  25.84 
 
 
308 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.93 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  32.58 
 
 
325 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.1 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.46 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  32.1 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  27.33 
 
 
392 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  27.94 
 
 
364 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  54.3  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.75 
 
 
380 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  31.78 
 
 
312 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  32.58 
 
 
383 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.52 
 
 
362 aa  53.5  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  28 
 
 
372 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  35.23 
 
 
314 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  33.68 
 
 
229 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  27.33 
 
 
349 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  31.46 
 
 
369 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  30.34 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  30.1 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  30.34 
 
 
375 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.07 
 
 
695 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  30.22 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2788  hypothetical protein  44.23 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  32.04 
 
 
308 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  30.34 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  28.16 
 
 
315 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  32.93 
 
 
372 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
384 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.42 
 
 
265 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.34 
 
 
343 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  32.94 
 
 
383 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>