185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0840 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 
238 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  40.08 
 
 
275 aa  202  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.5 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  42.92 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  42.92 
 
 
261 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.03 
 
 
251 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.69 
 
 
259 aa  188  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  40.74 
 
 
267 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.57 
 
 
262 aa  180  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  34.84 
 
 
247 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  34.86 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  32.95 
 
 
275 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  29.82 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.52 
 
 
270 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  29.67 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.08 
 
 
290 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  32.35 
 
 
277 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.76 
 
 
287 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.1 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.63 
 
 
311 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.02 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.46 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.64 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.01 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  26.98 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  32.78 
 
 
374 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.56 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.19 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.37 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  28.93 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.97 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.71 
 
 
331 aa  55.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.07 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  42.31 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.45 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  27.78 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  38.46 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  43.84 
 
 
380 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  27.85 
 
 
326 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  43.84 
 
 
389 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  28.73 
 
 
380 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  28.73 
 
 
380 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
354 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.89 
 
 
357 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 
384 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 
384 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 
384 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 
384 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 
384 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  31.06 
 
 
324 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.67 
 
 
380 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  52  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.65 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  28.65 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  28.65 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  41.1 
 
 
404 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.65 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.47 
 
 
380 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  43.06 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  35.16 
 
 
330 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  39.44 
 
 
411 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  42.25 
 
 
379 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
379 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  39.44 
 
 
379 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  39.44 
 
 
411 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
379 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.03 
 
 
362 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  38.03 
 
 
362 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.41 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  39.73 
 
 
372 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  37.84 
 
 
375 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00061  hypothetical protein  44.12 
 
 
324 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.69 
 
 
386 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  29.7 
 
 
380 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  26.28 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.34 
 
 
376 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  31.75 
 
 
373 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.75 
 
 
450 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  38.03 
 
 
359 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  43.04 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  37.5 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00061  hypothetical protein  40.28 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  28.85 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  30.71 
 
 
415 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  27.5 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>