49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0721 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 
311 aa  654    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  55.07 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.48 
 
 
285 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.57 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  44.61 
 
 
273 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.61 
 
 
270 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  42.6 
 
 
275 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  42.55 
 
 
275 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.93 
 
 
287 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  34.98 
 
 
277 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  31.34 
 
 
247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  30.74 
 
 
261 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.17 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  29.2 
 
 
275 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  26.43 
 
 
261 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  26.62 
 
 
265 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.16 
 
 
261 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.73 
 
 
251 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  28.51 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.63 
 
 
238 aa  87  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.51 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.56 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.35 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.11 
 
 
344 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.11 
 
 
344 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.11 
 
 
344 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.43 
 
 
450 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.67 
 
 
380 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.25 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  25.62 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.06 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.06 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.06 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.06 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.06 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  26.06 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  26.06 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  26.06 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  26.06 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  28.77 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.19 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.19 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  30.25 
 
 
404 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  30.08 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  29.41 
 
 
404 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  32.97 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.19 
 
 
331 aa  42.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  24.19 
 
 
367 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.06 
 
 
265 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>