76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05220 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  38.05 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  37.37 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.32 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.81 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0774  iron-sulfur cluster-binding protein  40.71 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.74 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0430  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.88 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.98 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.036747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0122  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.71 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  30.99 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  31.71 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.35 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  31.98 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1199  hypothetical protein  31.3 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.4 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.2 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  27.92 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.16 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.19 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  35.94 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  34.45 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.58 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  33.6 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  22.94 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.29 
 
 		 450 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.51 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  31.11 
 
 		 398 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 450 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  30.19 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  33.33 
 
 		 354 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  27.65 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.17 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.55 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  31.67 
 
 		 445 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0493  protein of unknown function DUF1730  30.58 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 		 398 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  31.13 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  30.51 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  23.08 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  23.96 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.02 
 
 		 445 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  31.97 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  31.97 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  32.63 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  30.48 
 
 		 455 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  26.15 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  29.31 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  30.48 
 
 		 455 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.97 
 
 		 343 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  31.43 
 
 		 455 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  33.04 
 
 		 375 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.36 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  28.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  28.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  28.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  28.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  27.82 
 
 		 385 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  24.07 
 
 		 414 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  28.97 
 
 		 326 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 		 385 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.24 
 
 		 617 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.79 
 
 		 380 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00061  hypothetical protein  26.45 
 
 		 318 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>