More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1392 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  100 
 
 		 376 aa  782    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  84.37 
 
 		 375 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  84.37 
 
 		 375 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  57.95 
 
 		 389 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.87 
 
 		 380 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.87 
 
 		 380 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  57.33 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  57.33 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  57.33 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.33 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  57.87 
 
 		 380 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.33 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  57.6 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  56.42 
 
 		 380 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  57.07 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  57.07 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  46.67 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  43.63 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  38.65 
 
 		 380 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  37 
 
 		 414 aa  242  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.96 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  34.77 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  30.43 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.29 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.24 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.29 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  31.08 
 
 		 380 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  34.13 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.33 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0493  protein of unknown function DUF1730  31.71 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  31.2 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  30.97 
 
 		 383 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.91 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  30.46 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  30.46 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  30.85 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  31.1 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  31.01 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  31.43 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  28.21 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  31.2 
 
 		 350 aa  175  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.95 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  29.75 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  29.51 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  34.39 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.05 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  30.51 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.95 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  28.9 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  32.43 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.97 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.1 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  29.97 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  29.21 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.95 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  31.71 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.38 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.38 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.38 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  30.74 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.4 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  31.82 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  33.54 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.77 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  29.86 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.11 
 
 		 384 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  30.37 
 
 		 366 aa  170  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  31.23 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.11 
 
 		 384 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.1 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  30.77 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.13 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.75 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  33.33 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  32.21 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.16 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  31.6 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  30.09 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  29.13 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.41 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  29.01 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  27.19 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.73 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.36 
 
 		 357 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  30.53 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.9 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  28.95 
 
 		 380 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2625  iron-sulfur cluster-binding protein  29.6 
 
 		 385 aa  165  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.913512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  28.78 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.57 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  30.9 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  29.24 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.94 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>