240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2545 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2545  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
375 aa  779    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00348974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  32.41 
 
 
380 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  31.79 
 
 
383 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.15 
 
 
380 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  32.38 
 
 
389 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.9 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  29.9 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  29.9 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.15 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.9 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.9 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.15 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.9 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  29.65 
 
 
380 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  29.65 
 
 
380 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  30.75 
 
 
376 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.97 
 
 
375 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.97 
 
 
375 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0999  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.5 
 
 
344 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.986306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  32.2 
 
 
380 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  28.61 
 
 
380 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  31.17 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  28.65 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.33 
 
 
398 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.33 
 
 
404 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.79 
 
 
386 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.03 
 
 
374 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  29.06 
 
 
408 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  33.07 
 
 
347 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  29.92 
 
 
385 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  29.44 
 
 
383 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  27.58 
 
 
404 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2025  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  30.29 
 
 
349 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.82 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  27.13 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  32.03 
 
 
326 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  27.76 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  31.78 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  30.43 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.33 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  27.38 
 
 
363 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.44 
 
 
388 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.89 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  26.63 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.2 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.09 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  26.85 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  29.51 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.21 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  27.9 
 
 
354 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.9 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  29.72 
 
 
335 aa  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  27.65 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  30.83 
 
 
318 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3301  4Fe-4S cluster binding  28.1 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  27.32 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  26.11 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  30.36 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  29.73 
 
 
445 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  28.77 
 
 
354 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  26.32 
 
 
375 aa  87  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  27.04 
 
 
372 aa  87  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  27.67 
 
 
324 aa  86.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  28.27 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  27.62 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5125  iron-sulfur cluster binding protein  27.75 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0783629  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  27.59 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.77 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  27.71 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.66 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1713  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.3 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  26.11 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  26.11 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  26.11 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  26.11 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  26.11 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  29.29 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.29 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  26.11 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  26.11 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  27.37 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.29 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  27.38 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  27.1 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  25.83 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  28.92 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  27.89 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  27.84 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0567  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.25 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000095746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  25.83 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.27 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.66 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.6 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  28.85 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  27.15 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  28.97 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  27.2 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  27.54 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.25 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>