236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0999 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0999  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 		 344 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.986306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2545  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.5 
 
 		 375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00348974  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  29.97 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  30.21 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  31.98 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.59 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  31.47 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  28.61 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.9 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.17 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  27.38 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  29.13 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  29.39 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.8 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.87 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  27.12 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  25.42 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  26.14 
 
 		 374 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  30.65 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  32.05 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.88 
 
 		 398 aa  92.8  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  27.48 
 
 		 389 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.88 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2585  iron-sulfur cluster binding protein  32.21 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  28.65 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.49 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  26.67 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  33.82 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.2 
 
 		 357 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.83 
 
 		 372 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  27.22 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  39.44 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  26.3 
 
 		 383 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.35 
 
 		 380 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  43.36 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  27.56 
 
 		 306 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  28.27 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0735  iron-sulfur cluster binding protein  30.77 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2561  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.73 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  28.63 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1950  4Fe-4S cluster binding  31.73 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.926521  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  26.93 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  29.53 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.82 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  26.1 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  28.29 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  27.47 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5893  4Fe-4S cluster binding protein  30.95 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  26.65 
 
 		 387 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2480  iron-sulfur cluster binding protein  30.29 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198365  normal  0.0353934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  30.95 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.95 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2609  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.29 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.95 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.95 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.95 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  30.95 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  37.06 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.95 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.06 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  27.15 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00061  hypothetical protein  26.2 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  28.69 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.15 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  38.1 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  32.56 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3639  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.15 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.894476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  27.84 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  25.95 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  27.73 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.45 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  27.68 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.83 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  27.97 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  27.56 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  40.18 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  41.07 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  31.62 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  30.27 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.52 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.52 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  26.56 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  25.21 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  24.66 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.42 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  29.71 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  37.93 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  28.74 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  30.4 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.5 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.57 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  38.28 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  26.09 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  26.79 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  24.66 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.73 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  34.12 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  34.12 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  34.12 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>