148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0329 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 		 640 aa  1321    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  89.06 
 
 		 640 aa  1209    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  89.06 
 
 		 640 aa  1209    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  30.67 
 
 		 1070 aa  130  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  28.9 
 
 		 1069 aa  130  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  28.89 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  31 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  30.74 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  29.74 
 
 		 445 aa  122  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  29.44 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  30.04 
 
 		 399 aa  101  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  28.01 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  29.46 
 
 		 474 aa  99  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.64 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  26.9 
 
 		 461 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.64 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.77 
 
 		 474 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  25.76 
 
 		 352 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  27.52 
 
 		 472 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  25.98 
 
 		 507 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  28.12 
 
 		 532 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  23.87 
 
 		 455 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  24.34 
 
 		 455 aa  87.4  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  23.37 
 
 		 455 aa  87  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  26.75 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  28.63 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.92 
 
 		 532 aa  82.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  25.45 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  24.23 
 
 		 550 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  27.78 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  25.91 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  27.78 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  25.07 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  22.68 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  23.24 
 
 		 494 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  28.36 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  26.23 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  23 
 
 		 507 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  24.92 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  23 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  22.72 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  25.81 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  23.93 
 
 		 505 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  30.11 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  30.11 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  23.71 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  26.98 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  26.46 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  24.82 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  24.22 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  23.74 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  23.37 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  25 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  23.55 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  25.24 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  23.81 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  24.27 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  26.13 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  21.07 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  23.41 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  23.87 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  23.79 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  24.15 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  22.36 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  23.9 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  24.44 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  25 
 
 		 488 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  26.37 
 
 		 473 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  27.59 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.93 
 
 		 231 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  24.84 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  29.41 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  22.94 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  25.86 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  25.86 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  25.86 
 
 		 496 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.8 
 
 		 226 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  25.11 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  21.04 
 
 		 475 aa  55.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  24.37 
 
 		 510 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  21.43 
 
 		 481 aa  54.3  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0117  hypothetical protein  33.62 
 
 		 105 aa  53.9  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  21.58 
 
 		 514 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  23.24 
 
 		 385 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.95 
 
 		 265 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  25.11 
 
 		 523 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.11 
 
 		 357 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.84 
 
 		 263 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  26.21 
 
 		 374 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  21.61 
 
 		 514 aa  52  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  21.51 
 
 		 514 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  28.12 
 
 		 314 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  23.4 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 238 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.19 
 
 		 309 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  25.88 
 
 		 308 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.01 
 
 		 382 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  25 
 
 		 473 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  28.46 
 
 		 392 aa  48.5  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  23.4 
 
 		 383 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>