115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1729 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  100 
 
 		 472 aa  988    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  81.01 
 
 		 474 aa  796    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  48.16 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  44.83 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  29.96 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  30.15 
 
 		 514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  35.77 
 
 		 550 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  34.89 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  30.43 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  31.39 
 
 		 507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  32.08 
 
 		 458 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  33.21 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  33.21 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  31.75 
 
 		 445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  32.84 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  30.11 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  32.71 
 
 		 532 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  32.34 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  36.84 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  30.89 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.96 
 
 		 532 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  30.73 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  31.63 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  30.21 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  28.08 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  30.86 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  28.08 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  29.36 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.48 
 
 		 491 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  29.22 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  31.34 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  29.63 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.4 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28 
 
 		 484 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  26.68 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  30.3 
 
 		 497 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.79 
 
 		 640 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.79 
 
 		 640 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.52 
 
 		 640 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  31.23 
 
 		 1069 aa  87  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  29.36 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  28.42 
 
 		 1070 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  30.99 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  26.64 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  30.57 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  33.33 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  30.45 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  29.47 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  29.43 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  30 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  28.89 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  29.92 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  30 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  27.56 
 
 		 512 aa  76.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  30.39 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  31.71 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  29.21 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  29.2 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  27.11 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  32.11 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  32.37 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  33 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  31.96 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  31.96 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  26.85 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  31.52 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  31.05 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  33.33 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  28.16 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  31.6 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  31.95 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  31.41 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  32.56 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  31.36 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  29.94 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  31.07 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  28.83 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  26.21 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  29.3 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  34.26 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  27.43 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  28.95 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  28.64 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  29.59 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  25.36 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  26.9 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.15 
 
 		 263 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  26.7 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 268 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.03 
 
 		 226 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.3 
 
 		 227 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.49 
 
 		 308 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  26.11 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 263 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 233 aa  50.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  28.09 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 226 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  28.03 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.81 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>